研究检查了与 COVID-19 变异动力学相关的关键因素

洛斯阿拉莫斯国家实验室的一组研究人员最近发表了关于全球 COVID-19 变异转变的最全面研究，该研究表明，变异在全球范围内传播的显着差异与疫苗接种率、共同传播变异的数量和对先前感染的免疫力有关。

向 GISAID 报告的所有 SARS-CoV-2 序列的每日变异组成（a）全球和（b）四个示例国家（点）以及来自主要分析的拟合变异比例（线）。拟合线显示通过拟合（方程式 1）中的多项式模型获得的点估计。标绘点的大小对应于测序样本的总数，相对于每个国家/地区的每日最大值。对于图 (a)，给定日期归因于每个变体的全球序列与该日期每个序列对应国家/地区报告的确诊病例成比例加权。

实验室统计科学小组的 Lauren Beesley VanDervort 和该论文的第一作者说：“这项工作汇集了一组不同的数据流——人口统计学、临床、行为和其他——以真正挖掘过去的变异转变在全球范围内的样子。” “它还有助于确定可能的解释，解释为什么这些转变在全球范围内差异如此之大。”

自 2020 年 1 月获得第一个 SARS-CoV-2 病毒序列以来，全球已有超过 6.6 亿例 COVID-19 确诊病例，导致 670 万人死亡。该病毒继续进化，全球向新变种的转变可能会引发疾病传播浪潮。

“这项研究提供了 SARS-CoV-2 变体转变的综合观点，表明影响新变体相对适应性的因素是复杂的，”洛斯阿拉莫斯理论生物学和生物物理学小组的 Bette Korber 说。“过渡的速度和完成程度都取决于它所经过的 人群中的 SARS-CoV-2 感染史。”

该研究小组查看了大流行数据，以描述 2020 年 10 月至 2023 年 1 月期间 230 个国家和地区的 16 种 COVID-19 变体转变的速度、日历时间和幅度的差异。利用这些数据，他们发现 COVID-19 疫苗有助于减缓在 delta 变体出现之前新变体转换的速度。然而，持续的病毒进化导致了新一波的疾病传播，病毒变体的传染性越来越强，并且对保护性抗体具有抵抗力。

该团队还发现，不同地点的历史变异转变动态存在显着差异，并且与疫苗接种率、先前感染率、自上次 COVID-19 高峰以来的时间、人口统计数据以及与新出现变异竞争的共同传播变异的数量有关.

具体而言，他们发现，由于先前感染率较高且自上次 COVID-19 高峰以来的时间较短，因此从先前感染中获得的免疫力更强，与相对于其他国家的较晚和较低的高峰流行变异转变有关。这表明，在最近爆发大规模疾病的地区，新变异的转变可能会更慢。

虽然较高的疫苗接种率与 delta 和 mu 变体之前的较慢过渡有关，但 delta 和 mu 是关键的转折点。在 omicron 变体中，这种关联减少了，这与 omicron 对疫苗产生的抗体的抵抗力一致，这是防止感染的一个关键方面。

洛斯阿拉莫斯信息系统和建模小组的 Sara Del Valle 说：“这项工作可能能够为预测新兴变体如何表现以减轻其影响的建模方法提供信息。”