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一项癌症范围的分析发现了癌症范围内的肿瘤减少目标

2023-4-3 08:43| 发布者: admin| 查看: 25| 评论: 0

摘要: 圣路易斯华盛顿大学医学院的研究人员在转座因子 (TE) 中发现了癌症免疫治疗的潜在新靶点,TE 是可以在基因组中移动的短 DNA 片段。肿瘤特异性 TE 嵌合转录物的细胞系表达。a,箱形图与在各种肿瘤类型中描述的每个癌 ...

圣路易斯华盛顿大学医学院的研究人员在转座因子 (TE) 中发现了癌症免疫治疗的潜在新靶点,TE 是可以在基因组中移动的短 DNA 片段。

肿瘤特异性 TE 嵌合转录物的细胞系表达。a,箱形图与在各种肿瘤类型中描述的每个癌细胞系中表达的候选者数量的重叠点图。'N=' 列出了每个箱线图中的细胞系数量。箱线图格式:中心线、中位数;框限制,上四分位数和下四分位数;胡须,1.5 倍四分位数间距。b,我们分析的 10 个癌细胞系中候选者的 CAGE-seq TPM 表达热图。顶部是一个点图,显示了候选者中有多少 TCGA 肿瘤样本。

在发表的论文中,研究人员使用了癌症基因组图谱 (TCGA),这是一个包含 20,000 多个癌症样本的数据库,涵盖 33 种不同的癌症类型和 675癌细胞系。

该论文重点关注存在于人类基因组中但通常处于休眠状态的转座因子(TE) 。顾名思义,这些是可以将自身插入其他基因的 DNA 片段。典型的例子是一种逆转录病毒,它将它的一些遗传密码整合到宿主的基因组中。基因组为这种入侵做好了准备,持续的复制和插入通常被“关闭”。

当癌症发展时,它们会在没有很多正常遗传故障保护的情况下发生,因为它们通常起源于一开始就损坏了 DNA 的细胞。在复制过程中,癌症允许这些休眠的 TE 重新获得它们在癌细胞内的转座能力,并且根据该研究,“驱动非典型转录本的表达,这些转录本有时可以在肿瘤样本中高度表达和广泛共享。”

正因为如此,研究人员能够在 98% 的不同类型的肿瘤中发现 TE,并发现“这些转录本有可能产生新的肽,而这些肽不存在于良性组织中”,这表明一种新的方法跨癌症类型的靶向肿瘤。

该研究确定了 1,068 种肿瘤特异性 TE 候选物,它们有可能产生共享的肿瘤特异性 TE 嵌合抗原 (TS-TEA)。目前有针对特定抗原类型的癌症治疗方法,需要更多的研究来确认可以利用该途径用这些 TS-TEA 攻击肿瘤细胞。

医学总是在小的、反复的发现步骤中运作,导致充满警告的潜在途径来构想治愈方法。这里的不同之处在于,许多治愈途径已经走过。

目前的研究揭示了肿瘤内部的一种机制,它正在为现有的治疗方法创造可能的目标。这一发现可能会导致癌症治疗的新治疗方法,并且强烈建议通过进一步研究可以开发一种单一的治疗类型来治疗全身的多种癌症类型。


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