基因组学帮助在澳大利亚鉴定出一种新的 A 型链球菌菌株，以及它的危险性 ...

A 组链球菌，也称为“链球菌 A”，在世界范围内呈上升趋势，英国和欧洲报道了一种新菌株。这种变异与猩红热的激增和危及生命的侵袭性链球菌感染显着增加有关。

现在，我们的科学家团队在上发表的基因组研究 首次在澳大利亚社区发现了这种新菌株。与此同时，我们发现新南威尔士州、昆士兰州、西澳大利亚州和维多利亚州的侵袭性链球菌 A 型病例有所增加。

链球菌 A 是一种常见的细菌，主要由人们的喉咙携带。它会引起轻微的疾病，包括喉咙痛、猩红热（以它引起的红色皮疹命名）和脓疱病（“学校疮”）。但它也可能导致“侵入性”疾病，例如败血症。反复感染链球菌可导致其他严重疾病，包括急性风湿热和风湿性心脏病。

我们研究了称为“M1UK”的新链球菌 A 菌株的遗传组成，并着重研究了它与之前菌株的不同之处。

我们对链球菌 A 的了解

Strep A 只感染人类，大约10% 的学龄儿童携带它。它每年在全世界 造成超过50 万人死亡。

我们对这种细菌的了解已有 100 多年的历史，它是19 世纪和 20 世纪初儿童死亡的主要原因。但自从开发出治疗它的抗生素药物以来，它对公共健康的威胁就不那么严重了。在 1980 年代，一种称为“M1”的链球菌 A 菌株成为高收入环境中侵袭性链球菌 A 感染的主要原因。

在过去十年中，英国和中国报告了猩红热 A 型链球菌感染的死灰复燃。

侵袭性感染很少见。但一旦发生，感染者的 死亡率可高达20% 。

这种菌株有什么不同？

链球菌 A 的 M1UK 变体于2019 年在英国首次报道，并使用基因组学进行了鉴定——研究 DNA 序列以确定生物体基因组成的变化。

英国科学家发现 M1UK 变体表达的特定链球菌 A 毒素比之前的 M1菌株多五倍，但他们不确定如何表达。这种毒素最初被称为“猩红热毒素”，它通过使宿主的免疫系统短路而与侵袭性链球菌 A 的发展有关。

我们的实验室团队开始尝试了解细菌的哪些变化导致了这种表达的增加。

我们查看了链球菌 A M1UK 变体的遗传密码，并将其与之前的变体进行了比较。我们发现了许多突变，其中一个位于毒素基因附近。

然后我们逆向修复这种变化，看看它如何影响表达的毒素量。通过这种方式，我们确定了 M1UK 链球菌 A 如何变得毒素增压的机制。

我们会看到更危险的链球菌 A 菌株吗？

基因组学帮助我们识别和追踪细菌变异。然后，科学家们需要在生物学背景下利用这些知识来弄清楚一种菌株如何获得竞争优势，从而在之前的菌株中占据主导地位——就像 M1UK在英国所做的那样

这种新的链球菌 A 菌株可能更善于在人与人之间传播，但我们需要更多的研究来了解情况是否如此。

侵袭性链球菌 A 现在是一种法定传染病

侵袭性链球菌感染于2021 年 7 月被添加到澳大利亚的国家法定传染病清单中，为其在各州和领地的正式记录铺平了道路。这意味着检测到的侵袭性链球菌 A 病例会报告给中央登记处，以便当局可以跟踪疫情和病例数。

我们的研究人员将可以访问国家链球菌 A 菌株的储存库。我们将在AusPathoGen计划内试行全国链球菌 A 基因组监测计划，这将加快我们识别和追踪新出现的链球菌 A 变体的能力。

我们已经看到此类基因组研究如何帮助追踪 COVID 变化并指导公共卫生应对措施。通过与公共卫生合作伙伴一起 开展这个试点项目，我们的目标是建立一个全国侵入性 A 型链球菌监测框架。

人们如何保护自己？

侵袭性链球菌 A 仍然极为罕见，因此无需惊慌——但我们也不应自满。

基本的卫生习惯和生病时远离他人对于防止传播 仍然很重要。

儿童或老人更容易感染侵袭性疾病，因此，如果您发现高烧（尤其是皮疹）、受感染的皮肤溃疡引起的剧烈疼痛以及呼吸困难等症状，您应该去当地医院就诊急诊室或立即咨询全科医生。

只要有抗生素，它们在治疗感染方面非常有效。

我们还需要考虑控制感染的替代方法。澳大利亚科学家处于开发全球链球菌 A 型疫苗的 最前沿。