肠道微生物如何成为病原体？

admin · 发表于 2022-4-2 11:24:20

大肠杆菌存在于人体肠道和其他地方。在那里它是无害的，但在某些条件下它可以成为病原体。
它会导致膀胱感染甚至败血症。由 TWINCORE 的 RESIST 教授 Marco Galardini 和巴黎大学医学院的同事领导的一组研究人员现在已经调查了该细菌的某些基因是否与所引起疾病的严重程度有关。

组合数据集的全基因组关联分析结果。a) 通过每个目标表型的多重测试校正 p 值阈值的单元数。b) 对于每个目标表型，具有显着相关联单元的基因数量。c) 每个目标表型的测试单元格映射到大肠杆菌 IAI39 的曼哈顿图；红色虚线表示用于调用显着关联的 p 值阈值。d) 尿路特征的放大曼哈顿图。在大肠杆菌 IAI39 中用基因名称注释的基因和相关的 unitigs 显示在第三个子面板中。

他们现在已经在《公共科学图书馆遗传学》杂志上发表了他们的发现。大肠杆菌，通常缩写为大肠杆菌，是人体肠道菌群的一部分。作为所谓的共生体，它通常不会在那里造成任何损害。然而，它可能成为肠道和其他器官中的病原体。

例如，在泌尿生殖道中，大肠杆菌会导致膀胱感染，在血液中会导致败血症。血液中毒是细菌感染的可怕后果，在 10% 到 30% 的病例中甚至可能致命。直到现在，还无法根据病原体的基因组成来预测这种感染的严重程度。

汉诺威 TWINCORE 的研究人员现在已经分析了某些大肠杆菌基因变异是否与更严重的病程有关。“我们进行了所谓的全基因组关联研究，” RESIST 研究小组微生物群落系统生物学负责人 Marco Galardini 说。“为此，我们对来自两项大型患者研究的细菌样本进行了测序，并将它们与感染过程相关联。” 分析中还包括年龄、性别或已知的既往疾病等特征。

Galardini 的团队无法确定决定疾病严重程度的基因。然而，他们发现了另一个有趣的发现：“某个基因盒显然与开始于泌尿道的感染有关，”Galardini 说。由此，可以得出避免危及生命的疾病的策略。“将来，人们可以在膀胱感染的情况下对病原体进行测序，然后决定是否应该调整药物治疗以作为预防措施，”Galardini 说。

研究人员无法证明细菌基因组与疾病进程之间存在联系这一事实并不一定意味着没有联系。“也可能是我们研究的样本数量太少，”加拉迪尼说。“模拟表明，需要十倍的样本数量才能更有信心地检测或排除这种联系。”

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